SMK Assa'idiyah 2 Kudus memiliki Masjid, Masjid ini berfungsi sebagai Sarana Ibadah, Untuk tempat kegiatan Pusat Pendidikan Agama, Tempat Menuntut Ilmu seperti mengaji dan Berfungsi sebagai pusat kegiatan pendidikan dan pengajian agama, baik yang formal maupun non-formal.